Медиатека

На данный момент ученые всего мира исследуют вирус 2019-nCoV. Рост числа жертв не прекращается и на данный момент превысил отметки 500 человек.

Чтобы победить вирус и сделать это максимально быстро, а главное эффективно, необходимы высокотехнологичные решения.
Компания Хеликон сотрудничает с компаниями QIAGEN и BGI, крупнейшими мировыми лидерами в сфере разработки и производства инновационных продуктов для молекулярной диагностики, научных и фармацевтических исследований. Реагенты компании QIAGEN рекомендованы Центрами по контролю и профилактике заболеваний США, а группа компаний BGI (Китай, США) активно поддерживает борьбу с коронавирусом в Китае.

На днях Центры по контролю и профилактике заболеваний США ( Centers for Disease Control and Prevention (CDC)) выпустили рекомендации по исследованию коронавируса.
В качестве готовых протоколов для выделения нуклеиновых кислот рекомендуются следующие наборы реагентов QIAGEN:

• QIAamp^® Viral RNA Mini Kit
• QIAamp^® MinElute Virus Spin Kit
• RNeasy^® Mini Kit
• EZ1 DSP Virus Kit

Данные наборы позволяют получать вирусную РНК из плазмы, сыворотки и бесклеточных биологических жидкостей (наборы предназначены для научных исследований).

На данный момент российские и китайские ученые усиленно работают над созданием вакцины от вируса. Специалистами Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии «Вектор» Роспотребнадзора (надежный и долгосрочный партнер Компании Хеликон) уже разработаны экспресс-тесты, благодаря которым в течение двух-четырех часов можно определить присутствие вируса в организме человека.

Минздрав России разработал и направил в регионы временные методические рекомендации по профилактике, диагностике и лечению коронавируса. Представленные рекомендации учитывают фактические данные, опубликованные специалистами Всемирной организации здравоохранения, китайского и американского центра по контролю за заболеваемостью, а также Европейского Центра по контролю за заболеваемостью в материалах по лечению и профилактике этой инфекции.

Методические рекомендации предназначены для врачей лечебно-профилактических учреждений инфекционного профиля, а также врачей-реаниматологов отделений интенсивной терапии инфекционного стационара, врачей первичного звена. Рекомендации носят временный характер и будут обновляться.

Также стало известно, что группа компаний BGI (Китай, США) поддержала борьбу с коронавирусом в Китае, выпустив РТ-ПЦР и секвенирующий наборы реагентов для детекции.

Компания MGI, входящая в группу BGI, оперативно разработала набор реагентов для ПЦР детекции в реальном времени коронавируса 2019-nCoV (novel CoronaVirus 2019) и уже поставила более 50 000 таких наборов в больницы и центры контроля заболевания Китая. Из них 20 000 наборов было пожертвовано в г. Ухань и провинцию Хубэй.

Председатель и соучредитель Ван Цзянь, а также команда сотрудников BGI прибыли в Ухань 25 января, чтобы возглавить группу экстренной помощи и создать центр координации действий в чрезвычайных ситуациях в Ухане.
Также компанией MGI был разработан набор реагентов для метагеномного секвенирования PMseq^®, который позволяет обнаруживать и идентифицировать коронавирусы, включая ранее неизвестные.
Этот набор используется совместно с системой сверхвысокопроизводительного секвенирования DNBSEQ-T7 того же производителя, которая работает по технологии cPAS (combinatorial Probe-Anchor Synthesis) с генерацией до 6 ТБ за запуск (около 1 суток). Два подобных секвенатора уже были отправлены в Ухань.

Указанные наборы реагентов, а также система DNBSEQ-T7 первыми получили разрешение Национального Управления Медицинской Продукции Китая (China’s National Medical Products Administration) на использование в противоэпидемиологических целях.

Кроме того, вся линейка высокопроизводительных секвенаторов MGI (DNBSEQ-T7, DNBSEQ-G400 и DNBSEQ-G50) получила CE-IVD марку в начале 2020 года.

29 января коллективом ученых, работающих на секвенаторе DNBSEQ-T7, была выпущена статья в журнале The Lancet, где приводились результаты исследования коронавируса 2019-nCoV: установлена первичная последовательность вируса, изучена его гомологичность другим вирусам группы, определен наиболее вероятный предок (SARS-CoV) и установлен природный резервуар вируса-предшественника (летучие мыши).

3 февраля, в Nature была опубликована статья Peng Zhou и соавторов из Уханьского института вирусологии. У семи пациентов с тяжелой пневмонией были собраны образцы 2019-nCoV. С использованием секвенаторов нового поколения BGI MGISEQ2000 и Illumina MiSeq 3000 был расшифрован геном нового короновоируса.

Исследователи установили, что геном 2019-nCoV на 79.5% идентичен геному вируса атипичной пневмонии, SARS-CoV. Однако, гораздо ближе новый вирус оказался к короновирусу летучих мышей, BatCoV RaTG13, с 96.2% сходством.
Другая группа ученых, Roujian Lu с соавторами, из Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний, подтвердила предыдущие результаты, и обнаружила сходство 2019-nCoV с еще двумя короновирусами летучих мышей, bat-SL-CoVZC45 и bat-SL-CoVZXC21.
Исследования проводились на базе Пекинского института геномики (BGI) на секвенаторе DNBSEQ-T7.

В обеих работах, отмечается, что между собой все геномы прочитанных представителей 2019-nCoV были идентичны друг-другу более чем на 99,9%. Авторы предполагают, что это свидетельствует о едином источнике 2019-nCoV.

Немного истории:

• группа BGI в 2003 году BGI провела сиквенс SARS вируса менее, чем за 20 часов, и разработала ИФА тест к нему за 4 дня,
• а в 2011 году провела быструю разработку бесплатного набора реагентов для детекции энтерогеморрагической E.Coli во время эпидемии в Германии.

Ссылки на источники информации:

• en.genomics.cn/en-news-5636.html
• genomeweb.com/regulatory-news-fda-approvals/
• thelancet.com/journals/lancet/
• genomeweb.com/sequencing/

Фото с VESTI.ru и BGI.com.